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- Publié le 26 avr. 2024
ANSES RECRUTEMENT
Ploufragan
Réf. 612755 - publié le 15 avril 2024
Informations générales
DOMAINE DE FORMATION
Sciences, techniques industrielles - Biologie
NIVEAU D'ÉTUDES
Bac +5
GRATIFICATION
Missions
ANSES RECRUTEMENT vous propose une offre d'alternance dans les domaines Sciences, techniques industrielles, Biologie à Ploufragan.
Le séquençage de génome complet (Whole Genome Sequencing – WGS) est une approche de plus en plus utilisée en surveillance pour caractériser et comparer les agents pathogènes. En effet, le WGS permet d’obtenir de nombreuses informations sur le génome de ces agents pathogènes depuis la reconstruction du génome bactérien, jusqu’à son typage en MLST (Multilocus Sequence Typing), cgMLST (Core Genome Multilocus Sequence Typing), la caractérisation de son mobilome (phages, plasmides), et la recherche de gènes spécifiques (antibiorésistance, virulence, ...).
L’Anses développe actuellement un outil dédié à l’analyse de données génomiques bactériennes obtenues par séquençage short reads Illumina® commun à tous les laboratoires de l’agence. Dans ce cadre, nous souhaitons améliorer nos étapes de caractérisation du mobilome (clustering de plasmides, recherche de gène d’antibiorésistance et de virulence) ainsi que de scaffolding en nous basant sur des graphes issus de pangénomes.
Sous l’encadrement de votre maitre d’apprentissage, vous serez amené à participer au développement des activités bioinformatiques inhérentes au bon fonctionnement de la plateforme de séquençage, participer au développement des outils nécessaires et au traitement de données issues du séquençage à haut débit.
Conditions particulières
Travail en laboratoire confiné
Profil
Vous préparez une formation en Master en contrat d’apprentissage
Compétences (connaissances attendues, savoir-faire et savoir être) :
- Compétences scientifiques et/ ou techniques en bioinformatique
- Connaissance approndie de languages de programmation (bash, python, snakemake)
- Autonomie sur l’environnements linux
- Aptitudes relationnelles et goût pour le travail en équipe
- Capacités rédactionnelles avérées et aptitudes à la communication orale
- Capacité d’analyse et de synthèse
- Maîtrise de l’anglais scientifique (communication écrite et orale)
- Aptitude organisationnelle, rigoureux(se) et dynamique,
Postuler
Nom du recruteur : DEVILLERS Hélène
